El Programa de Formación Integral del Instituto de Investigación en Humanidades y Ciencias Sociales, se basa principalmente en el Modelo Universitario de la UAEM, cuya estructura y dimensiones tienen como finalidad la búsqueda del desarrollo humano y por tanto, la formación de sujetos integrales.
Así pues, el Programa de Formación Integral del Instituto de Investigación en Humanidades y Ciencias Sociales, en sintonía con la visión y retos de la UAEM, promueve las acciones de iniciativa y toma de decisiones en los estudiantes, al priorizar en todas las formaciones las actividades de organización y participación, pues es en la organización y participación de proyectos que se combina la teoría con la práctica, se desarrollan capacidades para dirigir, resolver problemas y trabajar en conjunto; se estimula la creatividad, propicia una actitud de innovación y de búsqueda y, finalmente, encamina la formación integral hacia un proceso auto formativo.
Las modalidades consideradas en el documento base: Formación deportiva, Formación cultural y Formación académica, sumando la Formación en la conservación ambiental y Formación en el respeto a la diversidad.